Die Fritz-Karsen-Schule beschult Schülerinnen und Schüler von der 1. bis zur 13. Klasse. Dabei durchlaufen sie die Primarstufe von Klasse 1 bis 6, die Mittelstufe von Klasse 7 bis 10 und gegebenenfalls die gymnasiale Oberstufe von Klasse 11 bis 13. Die Klassen 1 bis 11 sind dabei in sogenannten Jahrgangsteams organisiert.

In den Klassenstufen 1 bis 3 sowie 4 bis 6 arbeiten die Klassen im jahrgangsübergreifenden Lernen (JÜL) . Jede der beiden JÜL-Stufen setzt sich aus drei Teams zu je drei Klassen zusammen. Somit lernen Schülerinnen und Schüler in 9 Klassen in JÜL1-3 und in 9 Klassen in JÜL4-6.

Ab Klasse 7 lernen die Schülerinnen und Schüler in jahrgangshomogenen Klassen. Die Jahrgangsteams sind fünfzügig. Die Jahrgänge 9 und 10 werden durch jeweils eine Lerngruppe “Praxislernen” ergänzt.

In der Einführungsphase der gymnasialen Oberstufe in Klasse 11 werden angehende Abiturienten in vier Klassen auf die Qualifikationsphase vorbereitet. In der zweijährige Kursphase im Jahrgang 12 und 13 arbeiten die Schülerinnen und Schüler propädeutisch um am Ende des vierten Kurshalbjahres die Abiturprüfungen erfolgreich abzulegen.

Die Fritz-Karsen-Schule als Gemeinschaftsschule setzt auch im Kollegium auf Teamarbeit. Sie bildet das Fundament jeglicher demokratischer Entscheidungen innerhalb der Schule. Alle Teams wiederum sind in der erweiterten Schulleitung (ESL) als weiteres Entscheidungsgremium der Schule vertreten.